Las autoridades peruanas, viendo la inutilidad de cualquier defensa, abandonan el puerto de Iquique, que es entregado a las tropas chilenas luego de la campaña militar de Tarapacá. En 1879, el gobierno de Chile de Aníbal Pinto se vio obligado a declarar la guerra a Bolivia y Perú por los conflictos acontecidos por las propiedades salitreras en el norte de Chile. El 19 de noviembre de 1879, se produjo la batalla de Dolores, resultando en un triunfo para las armas de Chile, enfrentadas a las topas al mando del general Buendía. Esto ocasionó como reacción que la ciudad de Iquique fuera abandonada por las autoridades peruanas, no sin antes ponerla a disposición del cuerpo consular. Posterior a ello, los cónsules de Alemania, Inglaterra e Italia, pusieron Iquique a disposición del ejército chileno, que bloqueaba el puerto con el acorazado Cochrane y la Covadonga. Chile tomó posesión de Iquique en forma pacífica el 23 de noviembre de 1879, a través del ministro de guerra en campaña, don Rafael Sotomayor Baeza, quien luego designó gobernador militar y civil al Capitán de navío don Patricio Lynch Solo de Saldívar que organizó la primera Municipalidad de Iquique bajo bandera chilena. Normalizadas las faenas mineras en las salitreras después de la ocupación chilena de Tarapacá, el gobierno fomentó la iniciativa privada transformando Iquique en la capital del salitre.

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